报告题目：分形与序列复杂度方法在生物信息学中的应用
内容简介：2003年人类基因组计划的完成，催生了基因组学与生物信息学两个前沿研究领域，生物学研究进入了后基因组时代。特别是随着ENCODE、Epigenome Roadmap等后续研究计划的推进，基因组中非编码DNA调控元件的转录调控作用以及相关的表观遗传调控机制成为当前生物信息学研究的热点。我们提出使用分形与序列复杂度等数学工具，包括混沌图表示、分形盒维数、序列的因子复杂度与拓扑熵等方法，量化提取转录因子蛋白质序列、基因组增强子序列、DNA甲基化等蛋白和DNA调控元件的本质序列特征，并基于此构建它们的全基因组预测模型，为它们的转录调控功能研究提供支撑与帮助。
报告地点：数学科学学院A426
报告时间：2018年11月17日上午9:00-11:00（星期六）
报告人：胡学海 (华中农业大学信息学院教授)
报告人简介：胡学海，男，教授，硕士生导师。2002年本科毕业于武汉大学数学系，2007年获武汉大学基础数学博士学位。2017年在美国加州大学河滨分校做国家公派访问学者。现任华中农业大学信息学院大数据科学系主任。担任Bioinformatics、BMC Genomics、BMC Bioinformatics、IEEE Computational Biology等多个SCI期刊的审稿人。
研究领域为分形几何学与生物信息学，多年来致力于探索分形与序列复杂度方法在生物信息领域，如全基因组DNA调控元件预测、功能蛋白质与功能基因的预测等方面的应用研究。主要研究内容包括基于序列因子复杂度方法的DNA甲基化的全基因组预测，基于联合三元组特征与分形特征的核受体蛋白预测，基于分形维数的DNA结合蛋白质预测。完成国家自然科学基金青年基金一项，在研国家自然科学基金面上项目《分形与序列复杂度方法在DNA调控元件预测中的应用》。已发表科研论文20余篇，其中以第一或通讯作者发表SCI论文13篇、EI论文2篇，分别发表在BMC Bioinformatics、International Journal of Molecular Sciences、Journal of Theoretical Biology、ActaArithmetica等国际SCI刊物上。
（撰稿人：汪晓银；审稿人：裴永珍）
数学科学学院
2018年11月12日
